Berichten

,

Toevalstreffer wateronderzoek levert betere detectiemethode voor coronavirus op

Wateronderzoek en het coronavirus zijn geen logische combinatie. Toch is het Delftse en Noorse onderzoekers gelukt om uit hun wateronderzoek een slimme toepassing te halen voor de detectie van het coronavirus. Toevallig – maar zeker niet minder nuttig.

Het doel van het NWO-domein TTW-project ‘WaterTagging: DNA-microparticles for tracing and modelling water flows and travel times in natural systems’ is om waterstromen in kaart te brengen. De Delftse onderzoekers, onder leiding van Thom Bogaard, gebruiken daarvoor microbolletjes van ijzeroxide met silicium. Deze bolletjes zijn gelabeld met een soort DNA-streepjescode. Ze worden vervolgens in een waterstroom ingebracht, om ze verderop terug te vinden. Door de streepjescode is te achterhalen wanneer en waar de deeltjes zijn ingebracht. Zo volgen de onderzoekers waterstromen, en kunnen ze bijvoorbeeld de bron van verontreinigingen opsporen. Eind 2018 kon het team het onderzoek uitbreiden, door middel van een Water JPI Europees samenwerkingsproject, UrbanWat, gefinancierd door NWO-domeinen ENW en SGW.

Samenwerking met Noorwegen

Vanaf het begin is er in dit onderzoek gekozen voor intensieve samenwerking met NTNU in Noorwegen. De Delftse postdoc van dit project, Sulalit Bandyopadhyay, bleef tijdens al het onderzoek verbonden aan NTNU, een onderzoeksgroep in Trondheim met expertise op het gebied van die microdeeltjes. Daar veranderden de onderzoekers de microdeeltjes om beter toepasbaar te zijn voor het wateronderzoek, maar ondervonden problemen bij het met DNA labelen van het microdeeltje. RNA daarentegen bleek wel goed te binden aan de oppervlakte van de microdeeltjes. En, een geluk bij een ongeluk, dat RNA is ook het genetische materiaal in het virus dat COVID-19 veroorzaakt.
Nieuwe detectiemethode

De Noorse onderzoekers bouwen voort op deze vinding bij de ontwikkeling van een nieuwe testmethode naar het coronavirus. Zij gebruiken de microdeeltjes om RNA te extraheren uit een oplossing die een monster van de patiënt bevat. Omdat de microbolletjes ijzeroxide bevatten, kan met behulp van een magneet het RNA gescheiden en gezuiverd worden. Vervolgens wordt de genetische code van dat gezuiverde RNA geïdentificeerd en vergeleken met het coronavirus. Deze nieuwe testmethode lijkt gevoeliger te zijn dan huidige methodes om het coronavirus op te sporen. In de projectgroep in Noorwegen wordt daarom nu opgeschaald om minimaal voor 150.000 tests per week aan microbolletjes te produceren in dat land. Of deze methode ook in Nederland zal worden toegepast is nu nog niet bekend.

Bron: NWO nieuws
Cover foto: Projectleider Thom Bogaard bij de watertagging testopstelling. Beeld: Technische Universiteit Delft | Frank Auperlé

/0 Reacties/door
, , ,

Partner samenwerking: Plaats delict onderzoek op een chip

Winnaars HTSM HiTMaT Call 2019 – KIEM-gelden

MinacNed partners Micronit en Saxion Hogeschool werken samen aan een onderzoeksproject: ‘Plaats delict onderzoek op een chip: Single cell analyse met behulp van microfluïdische systemen’. Dit project past in het thema Security en de projectpartners ontvingen in november 2019 een KIEM-geld toekenning van Holland High Tech.

Het lectoraat Advanced Forensic Technology van Hogeschool Saxion/Politieacademie, het lectoraat NanoBio en microtechnologiebedrijf Micronit werken samen aan de ontwikkeling van een systeem waarmee lopende zaken en cold cases in rechercheonderzoek sneller kunnen worden opgelost. Zij passen bestaande microbiologische technieken als single cell amplificatie (vermeerdering) toe om de problemen van mengprofielen en te weinig DNA weg te nemen. Door gebruik van een lab-on-a-chip systeem wordt het proces minder arbeidsintensief en is de kans op contaminatie miniem.

Samenwerking met de eindgebruiker

De techniek die ervoor moet zorgen dat het DNA uit een individuele cel tot bruikbare hoeveelheden vermenigvuldigd kan worden, wordt ontwikkeld door het lectoraat AFT van Saxion. Micronit bedenkt, ontwerpt en produceert de chips waarop deze procedure uitgevoerd wordt. Uiteraard staan beide partijen in nauw contact en vindt er over en weer veel overdracht van kennis plaats.

Ook de eindgebruikers zijn in beeld. Zo geeft de Nationale Politie aan aan welke vereisten dit lab-on-a-chip systeem moet voldoen om voor hen ter plekke bruikbaar te zijn. Alle partijen werken samen aan het uitbreiden van het netwerk en het vergroten van het consortium van meewerkende bedrijven/instellingen.

Een gedeelde passie voor het gezamenlijke doel

Er bestond al een connectie tussen het lectoraat NanoBio en Micronit, en van daaruit zijn banden ontstaan met de leerstoel Advanced Forensic Technology. Een gedeelde passie voor het gezamenlijke doel, het inzetten van lab-on-a-chip technieken voor forensisch onderzoek, is wat alle partijen bij elkaar brengt.

Praktijk-project voor studenten

Bij dit project zijn ook studenten betrokken van Saxion. Het mooie is dat dit ook leidt tot interactie tussen verschillende opleidingen. Zo zijn niet alleen studenten van de opleiding Forensisch Onderzoek bij dit project betrokken, maar helpen studenten Chemie en BioMedische Laboratoriumtechniek ook mee met het uitvoeren van de experimenten. Zo is dit voor studenten van meerdere studierichtingen een prachtig praktijk-project.

Resultaten

Het project is nog in de ontwikkelfase. Het eerste chip-ontwerp is klaar, maar vanwege de Corona-crisis ligt de productie van deze chips tijdelijk stil. Uiteraard was het winnen van het KIEM-geld een mooie opsteker die onderstreepte dat er ook vanuit maatschappelijk oogpunt belang aan het ontwikkelen van een dergelijke techniek wordt gehecht. Verder zijn er gesprekken gaande met mogelijke nieuwe partners. ‘Op deze manier willen we graag ons consortium, en daarmee het draagvlak voor dit project vergroten’, zegt Brigitte Bruijns, die namens Micronit Microtechnologies aan het project deelneemt.

Uitbreiding van de samenwerking

Er is naast dit project ook ruimte voor andere samenwerking tussen de partners. Bij het lectoraat Advanced Forensic Technology leeft de wens om de FO/NANO-lijn verder uit te breiden en de samenwerking te intensiveren. Dit is afhankelijk van de resultaten uit een initiële verkenning en van het beschikbaar komen van nieuwe subsidiemogelijkheden om de daadwerkelijke toepassingsmogelijkheden te realiseren.

HTSM HiTMaT Call 2020

Het KIEM-geld dat toegekend is aan dit project is onderdeel van de HiTMaT Call (Connecting High Tech pps in Maatschappelijke Thema’s); een open Call waarin wetenschappers uit bedrijfsleven en onderzoeksorganisaties een bedrag van € 25.000,- aan kiem-geld kunnen winnen om, in samenwerking met minstens één onderzoeksinstelling (hoofdaanvrager) en één ondernemer, hightech onderzoekinnovaties te verbinden aan maatschappelijke thema’s, in een uitwerking van een groot publiek-privaat samenwerkingsprogramma.

De HTSM HiTMaT call staat open voor indiening van samenwerking, lees hierover meer in deze call informatie.

Betrokken partners in dit project:

Ook in het nieuws?

Heeft u een project waar u iets over wil delen op de nieuwspagina van MinacNed? Graag nemen wij uw bericht mee op onze nieuwspagina en in de MinacNed nieuwsbrief. Heeft u een mooie samenwerking maar nog geen nieuwsbericht, dan is een interview ook een optie en schrijven wij het artikel voor u. Stuur uw idee of persbericht naar Aurélie Veltema, projectmanager MinacNed.

/0 Reacties/door
, ,

Additional investment for accelerated research programmes on corona

Minister of Health, Welfare and Sport Hugo de Jonge informed the House of Representatives on Wednesday 1 April that the cabinet is allocating a total of 42 million euros for research on the most urgent corona-related research questions. It is estimated that these additional funds will enable some 80 to 100 research issues to be investigated.

It is important that these resources are made available in a well-coordinated but also quick and simple manner. A substantial part of the 42 million euros will be awarded by ZonMw and NWO, who will work closely together to this end in research programming.

1. Fast incidental funding round for COVID-19 (‘first wave’)

Right after the coronavirus was detected in the Netherlands, incidental funding was used for targeted and urgent research on ways of combating the COVID-19 pandemic. This was funded by the Ministry of Health, Welfare and Sport (€4 million) and ZonMw (1 million euros); NWO has joined as well, making 1.5 million euros available.

The funding involves:

  • Medical research: monitoring recovering patients, the transmission of the virus to and from children, hospital epidemiology, the development of medication that can be used in the (very) short term, antibodies and virus evolution. Socio-scientific research proposals that examine the impact of social isolation and its consequences have also been prioritised. These projects have already been launched or will begin shortly. These studies are being coordinated by ZonMw.
  • Behavioural research: research on social distancing and its impact on the spread of the virus. This is being coordinated by the National Institute for Public Health and the Environment (RIVM).

It is also possible to apply for a small financial compensation (7,500 euros to 15,000 euros) for creative solutions for practical (hospital) care. For example for medical devices or to help care and assistance providers give vulnerable groups the right care and assistance. ZonMw is doing its utmost to respond to applicants within a week to ensure that creative solutions can be put into practice as quickly as possible.

A total of 6.5 million euros has been made available by the Ministry of Health, Welfare and Sport, ZonMw and NWO for this initial research.

More information on the website of ZonMw

2. COVID-19 research programme to be launched shortly (‘second wave’)

ZonMw and NWO are currently developing an additional research programme in close consultation with the Ministry of Health, Welfare and Sport and the field. This new programme will provide space for different types of research (action research, applied and fundamental research) on subjects similar to those in the accelerated incidental funding round, but which will also focus on the (broader social) consequences of the crisis and measures to be taken in the longer term.

The grants will be awarded in the near future. The entire programme will run until the end of 2024 at the latest, for monitoring and completion of all pathways.

A total of about 20 to 25 million euros has been made available for this type of research by NWO, ZonMw, the Ministry of Health, Welfare and Sport and the Ministry of Education, Culture and Science.

2. Fast-track data NWO research

To acquire data that can only be collected now, during the crisis, the NWO domains Social Sciences and Humanities, Science, and Applied and Engineering Sciences are developing a so-called ‘fast-track data’ request. Researchers can apply for funding for research that requires real-time data acquisition on issues emerging as a result of the crisis, data that can help to manage the crisis, or that can increase the learning capacity of society during a pandemic.

To ensure that the data can be collected as quickly as possible, NWO is doing its utmost to give applicants the go/no go within one working week. Researchers will make data and an initial analysis of this data openly accessible as soon as possible. Medical and care-related subjects are excluded from this enquiry. The call is already open and can be found below (English version will be made available as soon as possible).

In total, NWO is making 1.5 million euros available for this call: each NWO domain is contributing 0.5 million euros.

Read more on the Programme page Corona: fast-track data

/0 Reacties/door

Evenementen

Niets gevonden

Uw zoekopdracht leverde helaas geen artikelen op